杀菌灭藻剂对真菌的影响是多方面的。它通常通过影响细菌的生长和分裂、孢子萌发、呼吸抑制、细胞膨胀、质体解体和细胞壁破坏来抑制或杀死生物体。

    杀菌灭藻剂的杀菌或抑菌作用主要与杀菌灭藻剂的性质、浓度和作用时间有关。

    1、 破坏细胞结构

    （1） 细胞壁损伤：杀菌灭藻剂使细胞壁纤维和鳞片变形，不能完成正常的生理功能。它们有的阻碍细胞壁的形成，使细胞壁解体，导致细胞质外露。

    （2） 细胞膜破坏：杀菌灭藻剂会增加或扩大膜疏水链的“镶嵌”和裂缝，或杀菌灭藻剂分子的亲脂部分溶解膜上的脂质部分形成微孔。季铵盐杀菌灭藻剂就是这种作用，甚至膜上的金属离子也被螯合破坏。

    2、 破坏线粒体的功能

    线粒体在细胞呼吸的能量储存中起着重要作用。酚类物质可以抑制与氧化有关的酶和辅酶。二氯苯酚可与-SH反应，作用于辅酶A，阻止脂质氧化。有些杀菌灭藻剂破坏细胞内的氧化磷酸化偶联反应，而酚类杀菌灭藻剂则有这种作用。

    （3） 代谢障碍的原因

    DNA、RNA和mRNA是遗传和蛋白质合成的物质基础。杀菌灭藻剂可以掺入核酸中，并可能抑制蛋白质合成。

    （4） 对酶系统的影响

    杀菌灭藻剂降低酶含量或酶活性，导致物质代谢失衡。例如，酚类物质在很低的浓度下会使某些酶失活，而另一些则会增加它们的活性，从而加剧新陈代谢异常，或引起人工反馈抑制，引起细菌中毒。

    （5） 与细胞内成分的相互作用

    这主要是指代谢物和杀菌灭藻剂之间的相互作用，如与细胞内最活跃的官能团SH反应，干扰细胞内氧化还原过程，或螯合细胞内微量元素使某些酶失活。